王家槐：党委书记
主持食科院党委全面工作。协助院长抓食科院的生产经营和内控建设工作。负责党建、宣传、组织人事、老干部、共青团、统战、信访维稳、接诉即办、网络安全、人力资源及内控建设工作。分管党委办公室、人力资源部、产业部。
赵 燕：党委副书记、院长
主持食科院科技、经营、管理全面工作。负责财务、投资、行政办公、科技管理、信息化建设、传媒期刊运营管理等工作；分管财务部、办公室、科研管理部、分析与测试中心、未来食品科学与工程研究部、生物制造科学与工程研究部、食品质量检测中心（二站、三站、茶站）、杂志社。兼任中国肉类食品综合研究中心主任、法定代表人；兼任中国食品杂志社社长、法定代表人。
王喆：纪委书记、工会主席
负责纪委、纪检监察、工会工作；协助院长抓安全维稳等工作；分管安全保卫部。
陈华林：副院长
协助院长抓食科院的科技、经营、管理日常工作。负责动物疫病监测工作；分管畜牧兽医总站。兼任北京三元集团畜牧兽医总站法定代表人。
乔晓玲：副院长、总工程师
协助院长抓食科院的科技、经营、管理日常工作。负责动物源食品方向科研管理、物业管理、基建开发管理、培训楼经营管理等工作；分管食科院学术委员会、博士后工作站、动物源性食品研究部、政策经济研究部、物业部、房屋管理办公室。兼任肉研中心房屋管理办公室主任、兼任北京中酿杂志社社长、法定代表人。
王广杰：院长助理
协助院长抓食科院的生产经营及法治内控工作。负责食品安全、生产安全、法治建设、食品所日常经营管理等工作；分管食品所；兼任北京金美添技术发展有限公司经理、法定代表人；兼任北京市食品研究所有限责任公司经理、法定代表人；兼任人力资源部部长、安全保卫部部长、产业部部长。
李家鹏：院长助理
协助院长抓食科院的科技、经营、管理日常工作。负责审计、生物技术方向、植物源食品方向、环境科学方向、酿造食品科研管理；分管植物源性食品研究部、酿造科学与工程研究部、环境科学与工程研究部。兼任北京市食品酿造研究所有限责任公司经理、法定代表人；兼任生物制造科学与工程研究部部长。