北京食品科学研究院拥有一支专业结构齐全、层次搭配合理的科研队伍。其中，拥有以院士领衔的学术委员会，有“海聚人才”为首的研究团队，汇集了教授、高工等大批学科带头人、高级专业技术人才和管理人才，从事专业领域包括食品工程、食品安全、食品检测、生物工程、微生物、环境工程等，为科技项目的实施提供了人才保障。另外拥有一支由博士后、研究生、客座研究人员等人组成的流动科研队伍，以兼职、客座、实习及共同开发等形式，参与科技项目研究工作。固定加流动的人力资源结构为科技创新工作的开展提供了人才保障。